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前情回顾
孕妇因丈夫唇腭裂,于3+周来院做三维B超,结果发现胎儿上唇皮肤连线未见明显连续性中断,但胎儿右手裂手及双足裂足畸形(详情可戳→案例竞猜)。在采集表型过程中发现,先证者父亲除自诉的唇腭裂、并趾、多趾外,还有右足轻度足裂。考虑遗传综合征可能性大,夫妻双方慎重考虑后,要求终止妊娠。
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行基因检测,但结果提示VUS
为了查明病因,为下一胎提供生育指导,引产后取胎儿组织及夫妻双方外周血行Trio医学外显子测序,结果显示先证者携带TP63基因变异,该变异遗传自父亲。根据目前的变异分类证据(PM1、PM、PP3),该变异的ACMG变异分类为意义不明变异(VUS)。0
面对VUS变异,接下来如何做?
意义不明变异(VUS)极大地增加了咨询难度,而且在目前的医疗环境下,VUS变异位点无法行产前诊断。
故医生决定进一步收集表型、分析家系、查阅数据库及文献,根据ACMG序列变异解读的标准和指南,结合临床表型对变异进行更精准的分类。查询gnomAD频率该变异在ExomeSequencingProject、GenomesProject、ExomeAggregationConsortium、GenomeAggregationDatabase正常人群数据库中未收录,可以使用PM证据。
OMIM数据库查询TP63基因变异的临床表型
从TP63基因变异对应的综合征中,选择表型匹配度高的种综合征,可以看到,标黄表型与病例表型是吻合的。但牙齿、乳头、指甲方面的表型,是不存在?还是被忽略了?
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